spaces/shmelev/genatator-leaderboard

Наши учёные разработали новый подход, ускоряющий аннотацию геномов организмов Найти гены в ДНК сложно, у них нет универсальных сигналов начала и конца, а границы зависят от сочетаний коротких мотивов. Исследователи группы геномики AIRI создали нейросетевую модель GENATATOR, которая получает на вход последовательность ДНК и размечает в ней гены — находит их границы, определяет тип транскрипта и восстанавливает внутреннюю структуру. Главное отличие подхода в том, что система опирается не только на заранее заданные правила: он основан на обучении моделей на больших наборах геномов и поиске закономерностей непосредственно в последовательностях ДНК. Новая система работает поэтапно и может находить два основных типа генов: белок-кодирующие и гены длинных некодирующих РНК. Особое внимание разработчики уделили точности границ генов. Сбор данных для обучения модели провели учёные Научно-технологического университета «Сириус» и ИЦиГ СО РАН. HuggingFace | Лидерборд | dnalm | ТАСС